Analyse in situ

En étroite collaboration avec le Centre de Ressources Biologiques de l’ICM, ou à partir de prélèvements obtenus par le porteur de projet, nous proposons notre expertise à tous les membres de la communauté scientifique et médicale qui souhaitent analyser in situ l’expression de cibles dans des échantillons cliniques.

Nos domaines de compétences sont principalement :

• L’identification des ressources biologiques, en accord avec la problématique posée, en lien avec les cliniciens.
• L’analyse de l’expression in situ de cibles, que ce soit au niveau de l’expression du gène (hybridation in situ des ARNm) ou de la protéine (immunohistochimie), avec du matériel dédié : microtome, four d’hybridation, module automatique de démasquage antigénique, automate d’immunohistochimie, microscope avec caméra numérique. Une collaboration étroite avec la plateforme RHEM-IRCM ou le laboratoire d’anatomie et cytologie pathologiques de l’ICM permet de répondre aux besoins ponctuels en matériel ou sur une technique spécifique (colorations spéciales par exemple).
• L’interprétation des lames par du personnel expert (ingénieur et anatomo-pathologiste clinicien) et/ou automatisée (logiciel Histolab®,QuPath,..).
• La création de Tissues Micro Arrays (TMA) : après validation du projet par le CORT, nous mettons à disposition des porteurs de projet,  des cohortes de patients déjà constituées et cliniquement annotées.

Analyse par immunofluorescence multiplexée d’une coupe d’amygdale permettant de mettre en évidence la localisation des lymphocytes B (Pax5+, en bleu) autour d’un centre germinatif comportant des cellules folliculaires dendritiques (CD23+, en vert), des lymphocytes T (CD3+, en rouge). L’utilisation du marqueur Ki67 (en jaune) permet de mettre en évidence les cellules qui prolifèrent.